La multiplicité des bases et la diversité des formats, les impératifs de modélisation, les divergences de granularité descriptive, les enjeux de méréologie et granularité physique font des humanités numériques un lieu incantatoire des « bonnes pratiques » et de « l'interopérabilité ». Sans contester cette nécessité absolue, la place centrale de « l'outil » dans la capacité des sciences humaines dites « numériques » à poser de nouvelles questions imposent de repenser le rapport du chercheur, à la fois « early adopter » et « end user », à l'interface, à l'ergonomie et aux outils de visualisation (et de validation) des données.